“新冠病毒基因全长约30kb，编码的结构和非结构蛋白在功能上很多都是在其他病毒里发现过的，这一点都不奇怪。”刘善虑谈到，NSP6就像HIV（艾滋病毒）的毒力因子Nef，它也是非结构蛋白。而E蛋白能形成离子通道，这也和HIV的Vpu蛋白、HCV的p7蛋白功能非常相似。“这些小蛋白往往在最原始的病毒中是没有的，都是病毒后来为了对付宿主的先天免疫屏障慢慢进化出现的。”
刘善虑说，最简单的逆转录病毒MLV（鼠白血病病毒）只有三个最基本的蛋白，没有其他辅助蛋白，而HIV有6个辅助蛋白，还有3个调控蛋白，所以MLV对宿主的调节先天免疫能力就比HIV差了很多，尽管附属蛋白glycoGag有时也起些作用。“病毒最基本的结构蛋白就像盖房子所必需的砖块，而非结构蛋白是额外的修饰，多数为了抑制宿主的先天免疫。从病毒方面说只要能成功地复制产生下一代就可以，而不是把宿主杀死。所以辅助蛋白不是病毒主动的选择，而是不得已的进化办法。”
“病毒和宿主之间就像军备竞赛，总是想战胜对方，宿主的蛋白也会相应进化，所以经过几百年的长期进化过程，就像一场拉锯战。有的病毒因为适应新不强就被淘汰和消失掉了，只有那些在宿主体内具有高度适应新的病毒才会存活。”刘善虑说，新冠病毒有几个有限的结构蛋白和众多非结构蛋白，目前很多功能还不清楚。“我觉得未来从病毒学研究角度，要了解病毒和宿主的相互作用，这些蛋白都是相当重要的。”
新冠病毒新型传播机制，进一步逃避抗体中和
2023年1月7日，中科院上海要物所高召兵团队与武汉病毒所、昆明动物所联合研究团队报道了一种新型病毒传播模式，新冠病毒感染可产生一类新型胞外囊泡（EVs），这种囊泡可以装载大量病毒颗粒，不仅保护病毒免受抗体的中和，而且介导病毒以非经典受体人ACE2依赖的模式侵入宿主细胞，产生新的感染。
