秦始皇三十五年（前212年），由于“儒生”非议朝政，秦始皇一怒之下诛杀四百六十余人，扶苏得知消息后直言劝谏，但却因此被秦始皇发配上郡。那么，扶苏到底是因何被发配，秦始皇发配扶苏的目的又是什么呢？
发配原因：与秦始皇治国理念不同，没能理解秦始皇苦心
由于春秋战国以来的数百年分裂，秦始皇统一天下后面临的形势其实极为复杂，其中最为严峻的便是文化制度层面的割裂，虽然秦始皇通过一系列的变革基本实现了制度层面的统一，但文化差异却根本不是短期内可以消除的。
秦始皇虽然推崇法家治国理念，但也曾尝试接纳列国文化，他不仅没有阻止其他各派学者涌入咸阳，甚至允许他们登堂入室，对于六国文化和其他学派给予了最大限度的包容。例如融合儒、法、道三家学说的“五德始终说”，又如咸阳规划中体现出的道家“法天象地”；再如尊崇儒家和齐鲁文化的“泰山封禅”。
秦国与列国文化虽然皆TUO胎于周文化，但在发展的过程中，却吸收了大量的戎狄文化，且深受法家思想所影响，因而深受列国之鄙夷。即便六国皆为秦国所灭，但六国士子在文化层面仍保持着极大的优越感，在《淮南》《汉书》《荀子》等史料中，随处可见“刻薄寡恩”、“虎狼之国”、“贪狼强力，寡义而趋利”等词。
除了文化层面的差异之外，由于秦始皇在统一天下后实行集权统治，且派往各地的官员全部是熟悉秦国律法的秦人，这导致列国士子的晋升之路被彻底切断，虽然秦始皇也设立了“博士”职位，允许列国士子和其他学派学者参与朝政，但却仅有议政权而无实际权力，这引起了列国士子的极大不满，民间非议秦国新政的声音从来都没有停止。
秦始皇三十四年（前213年），秦始皇在咸阳宫摆酒设宴，七十余位官吏、博士参加了这场宴会。正是在这次宴会上，齐人淳于越以“事不师古而能长久者，非所闻也”为由，对秦始皇的中央集权统治提出质疑，并要求重新恢复分封制。要知道，中央集权制可是秦始皇统治的核心，淳于越此语无疑挑战了秦始皇的底线，于是当李斯提出“焚诗书”建议后，秦始皇当即予以同意。
“焚诗书”事件中，秦始皇不仅按照李斯的建议，下令焚毁除“医要卜筮种树之书”和官方藏书以外的所有诗、书和百家言论的书籍，而且严禁民间再有任何诗书、百家言论和攻讦朝廷政策的言论。
然而，就在禁令仅仅一年之后，又发生了侯生、卢生两位术士逃走的事件，两人不仅出逃，而且还在民间大肆非议朝政，结果惹怒秦始皇，始皇帝怒道，“卢生等吾尊赐之甚厚，今乃诽谤我，以重吾不德也。诸生在咸阳者，吾使人廉问，或为訞言以乱黔首”。
秦始皇从来都不是什么心慈手软之人，之前为了维护统治稳定，他可以忍耐，可一旦下定决心清除反对声音，他便不会再手软。于是，始皇帝“使御史悉案问诸生，诸生传相告引，乃自除犯禁者四百六十馀人，皆阬之咸阳，使天下知之，以惩後”。
且不论秦始皇诛杀的“儒生”到底是儒家子弟，还是术士，秦始皇此举无疑是为了杀机儆猴，防止民间再出现其他学派言论。然而，扶苏却根本没能理解秦始皇的苦心，反而站出来说道，“天下初定，远方黔首未集，诸生皆诵法孔子，今上皆重法绳之，臣恐天下不安。唯上察之。”
扶苏此举不仅是在攻击秦始皇的施政举措，而且在思想层面明显倾向于儒家思想，岂能不令秦始皇恼怒？不过，对于外人秦始皇还能痛下杀手，可扶苏毕竟是自己的儿子，无奈之下只能“使扶苏北监蒙恬於上郡”。
发配目的：到底是为了锻炼扶苏，还是将其彻底流放
既然扶苏是因治国理念不同而被发配，那么秦始皇将其发配上郡的目的是什么呢？有人说是秦始皇在有意锻炼扶苏，也有人说是秦始皇彻底放弃了扶苏。从现有史料来看，个人更倾向于后者。
先说锻炼之说。既然扶苏是因为治国理念不同而被发配，那么秦始皇的发配之举，有没有可能是为了让扶苏体验一下民间疾苦，希望其能够体谅自己的良苦用心呢？
这种可能新并非没有，但上郡显然不是合适的地方，原因在于上郡当时乃是在对抗匈奴的前线，在这里虽然能够体会到民间疾苦，但对于扭转扶苏的思想问题显然没有什么帮助，毕竟父子两人的冲突根本乃是在治国理念和文化层面。
再说流放之说。要知道自春秋战国以来便有“储君不外放，外放即被废”的定例，也就是说公子一旦被发配，便标志着其已经退出了继承人的争夺。其中最为典型的一个例子便是晋国“骊姬之乱”时，晋献公将太子申生发配曲沃，以致“ 晋国以此知太子不立也 ”。
虽说当时扶苏以监军的身份来到蒙恬营中，且蒙恬手中握有三十万重兵，可根据秦朝的制度，军队只有秦始皇才能调动。要知道“蕲年宫之变”时，即便嫪毐动用了太后赵姬的印玺，也没能调动军队，更何况扶苏一个发配的公子身份。
很多人持锻炼之说的一个很重要原因，便是认为扶苏乃是秦始皇钦定的继承人，虽然根据《史记》的记载，秦始皇临终之前，的确有意立扶苏为皇位继承人，但根据《秦始皇本纪》的记载，秦始皇临终之前命赵高给扶苏送去的诏书内容乃是“与丧会咸阳而葬”，只是让其返回咸阳参加葬礼，而并非立储，只是在《李斯列传》和《叔孙通列传》中说胡亥乃是“诈立”。
此外，根据《北京大学藏西汉竹书》第三卷的《赵正书》记载，秦始皇病重之时曾就继承人问题与李斯等大臣进行商议，当时丞相李斯、御史冯去疾便建议道，“今道远而诏期群臣，恐大臣之有谋，请立子胡亥为代后”，面对这个提议，秦始皇只说了一个字，“可”。
更为重要的是，扶苏在治国理念上与秦始皇有着严重冲突，而胡亥在赵高的辅佐下，却是从小接受法家思想教育，更为偏向法家治国理念，从这一点来讲，秦始皇立胡亥的可能新也更大。
如上所述，个人认为由于治国理念的冲突，秦始皇选择了将扶苏发配上郡，但很可能也是因此，秦始皇将扶苏排除在了继承人行列之外。至于让扶苏得到历练，这个可能新的确存在，但并不能就此认定秦始皇是在有意培养扶苏。
