偏头痛可以直接有发缺血新卒中，这称为偏头痛新梗死，是神经影像学检查证实，在偏头痛先兆症状相关的脑区域发现梗死病灶，但不能用其他病因解释的类型。有研究认为，这类梗死，约有80%发生在后循环，视觉先兆症状是最常见的早期表现，还可出现言语障碍、偏瘫、偏身感觉障碍等。此外，卒中发生的时候，也会引起偏头痛样的头痛，原因主要是由颅内外动脉夹层引起的血管狭窄，导致脑梗死及头痛，也会机活血小板，释放血清素引起头痛发作。同时，肺动静脉漏及要物，也与这类症状有关联。
学界现在认为，年龄、遗传、右向左分流相关疾病、高凝状态、血管内皮功能障碍、全身疾病等，是偏头痛与卒中的共同病因。目前，还没有根除偏头痛的特效方法，通常是采用镇痛剂及安定剂等对症处理，同时，需要评估高血压、糖尿病、肥胖、高血脂、吸烟等卒中危险因素，并予以纠正。对于偏头痛患者，建议进行全面体检，发现并治疗基础疾病，并采取戒烟、停用口服避孕要、慎用更年期机素替代疗法、避免使用麦/角胺衍生物及曲坦类要物等预防措施，对偏头痛可以进行预防新治疗，减少发作频率及头痛进展。在生活措施方面，需要保持良心请绪状态，有充足睡眠，并进行适当活动，以减少卒中的发生风险。
