张居正清理书院，无论清浊善恶，一一铲除，毫不容请
书院是中国传统的教育方式，一般是民间有学问的人在一起读书的地方，比较著名有岳麓书院、白鹿书院、嵩阳书院，这些书院都有上千年的历史。明朝的书院，不光是读书的地方，更重要的还是从事政治活动的场所。心学大师王阳明就利用书院广泛传播自己的思想，在当时很有影响力。
万历初年，泰州学派作为心学主流，思想解放，时不时地批评朝政，对张居正的改革颇有非议，批评张居正好大喜功，专权滥权。普通的谩骂，他张居正完全可以忍受，他从老师徐阶那里学到了隐忍之术，不会太在意别人对他的批评与指责。但是涉及政治，那就另当别论了。顺我者昌，逆我者亡。为了保证改革成功，他别无选择，无论清浊善恶，一一铲除，毫不容请。
万历三年，张居正制定十八条措施整顿学风，其中就有一条是禁止创建书院。理由很简单，读书就要到官办的学校读圣贤之书，各州府县学比比皆是，为什么要私自办学聚集论道？私自办学，妄议朝政，罪不容赦。一旦违反这一条，当官的罢官，老百姓抓起来治罪。张居正真实目的，就是要铲除政治上的隐患。
张居正说，吾所恶者，恶紫之夺朱也，莠之乱苗也，郑声之乱雅也，作伪之乱学也。张居正以实用为主，尽管他本人也曾从徐阶等人那里受到心学的熏陶，接受王阳明的观点，但对于昔日学友，还是毫不容请地挥起了镰刀。
王阳明心学泰州学派弟子何心隐思想机进，批评理学，抨击腐败，对张居正的专权也毫不客气，他活动量大，难以对付。但对于张居正来说，对付何心隐并不难。
万历七年，有一天，何心隐正在讲学，被湖广巡抚王之垣秘密逮捕，随后死于监狱。何心隐曾经对张居正的老师徐阶说，你不能兴旺心学，严嵩也不能灭亡心学。心学兴亡之间，在于张居正。可见何心隐识人还是很准的。
对张居正而言，这样做并非本意。他要一个相对清静的环境，好放手改革。所以，统一思想，控制舆论，也是无奈之举。
