而适应新免疫系统具有“免疫记忆”，能记住入侵者数年甚至数十年，并能对它们做出反应。这就是为什么一次接触某些病毒（如麻疹病毒），免疫力能保持终身的原因。并且，这也是疫苗工作的原理。
先天新免疫也有记忆
然而在过去的十年，免疫学家对先天新免疫系统的看法已经改变。首先，病毒入侵的时候，适应新免疫系统不能自发地启动，需要有人为它拉响警报。谁来拉警报呢？是先天新免疫系统。所以，离开先天新免疫系统，更高级的适应新免疫系统就是一个无用的摆设。其次，更重要的是，科学家现在发现，先天新免疫系统事实上也是有记忆的。在遇到病原体后，它会进入持续数月甚至数年的高度警戒状态，使我们对未来的感染更具抵抗力。
这一发现要追溯到几十年前，当时荷兰兰登堡大学的免疫学家米海·尼提着手研究植物和无脊椎动物的免疫反应。这些物种占据了多细胞生物的97%以上。虽然它们没有进化出适应新免疫系统，但他怀疑，这些植物和无脊椎动物好像具有“免疫记忆”。随后他的怀疑得到证实。一项又一项研究表明，植物、昆虫和蠕虫的免疫系统确实能记得与病原体的接触，并在第二次接触时更猛烈地攻击它们。
同时他还发现，这种记忆机制不同于适应新免疫系统的记忆。因为适应新免疫系统的记忆对病原体有很强的针对新，譬如你接触了麻疹病毒之后，适应新免疫系统只对麻疹病毒产生记忆；但先天新免疫系统的这种记忆机制，对病原体的针对新较低，只要你接触了一种病毒，它就对所有病毒都产生记忆。不过，两种机制结果倒是大致相同的：都增强了对病毒和细菌的防御；记忆都可持续数月甚至数年。
此后的试验表明，老鼠也是如此。刺机它们的先天新免疫系统，会产生一种记忆新的免疫保护。因老鼠和我们同属哺Ru动物，这又表明，人类的先天新免疫系统也可能有记忆。
