孙元良在抗战前期算是官运亨通，在淞沪战场上大放异彩，又因为死守四行仓库的八百勇士孤军而一度成为国际媒体的热点人物，但是淞沪会战之后，孙元良就没那么耀眼了，到抗战结束前，他已经离开了前线，到后方当重庆警备副司令去了。
整个解放战争的前期，孙元良也都是在后方吃喝玩乐中度过的，并没有参加内战。但是到了民国三十七年（1948年）国军统帅部决定组建机动兵团的时候，原来担任郑州绥靖公署主任的孙震的两个军也要被改编为机动兵团，而统帅部对孙震不放心，将孙震明升暗降，实际上是调虎离山。这样，孙元良就走马上任了。
孙元良是孙震的侄儿，但是又是黄埔一期生，所以是孙震和国军统帅部都能够接受的人物。他早年能够晋升那么快，很大程度上就是受益于他和孙震的这层关系，而后来被投闲置散，也同样是和这层关系多少有些瓜葛。所以，孙元良走马上任十六兵团司令，有些意外，但也算是一个机会。
孙元良
等到孙元良上任的时候，国军统帅部已经决心放弃郑州，开封了，准备集中兵力在淮海地区与解放军进行战略决战。这时候孙元良的十六兵团既可以去华中剿总白崇禧麾下，也可以去徐州剿总刘峙麾下，但是徐州要打大仗了，孙元良当然不太想去，倾向于去华中，但是国防部还是将他调往淮海战场。
十六兵团当时只有两个军，也就是川军四十一军和四十七军两个军，按照国防部的命令，先撤退到了蚌埠，到蚌埠后又配属了九十九军，一开始的任务是防守宿县，作为徐蚌会战的国军预备队，并不是在第一线参加战斗。这个任务孙元良其实还是比较满意的，毕竟还算是安全。
但是战场形势很快就发生了变化，张克侠、何基沣起义后，徐州城防空虚，刘峙只好把李弥兵团的一个军临时抽调出来担任徐州城防，同时要求孙元良兵团从宿县北上，迅速到徐州接替李弥兵团在九里山一带的防御任务，让李弥兵团全力救援黄百韬兵团。就在孙元良兵团北上之后，中野部队迅速攻占了宿县，切断了徐州到蚌埠的铁路。
邱清泉
这样一来，孙元良就和徐州的邱清泉兵团、李弥兵团捆绑在一起了。而且，和李弥、邱清泉相比，孙元良当时还兼着绥靖公署副主任，职位还要比他们高一点。但在从蚌埠北上的时候，九十九军被留在了蚌埠，这样孙元良兵团到徐州的时候实际上就还是两个军，而且装备比较差，实力不仅远不如邱清泉兵团，实际上也不如李弥兵团。
因为孙元良没想过自己要参加这么大规模的战略决战，所以思想上完全没有准备。之后无论是和李延年刘汝明两个兵团一起救援黄维兵团，还是从徐州撤退，孙元良的表现就是两个字，快跑。只要能逃命，别的什么他都不在乎。
从徐州撤退的时候，本来孙元良兵团是担任后卫的，但是孙元良给下属的军长、师长的命令是要跟着邱清泉兵团一起走，必要时可以平行甚至超越邱清泉兵团。而且，孙元良还下令兵团司令部关闭电台，不接收杜聿明的命令，一心一意要赶紧逃命。但是到了青龙集，还是被解放军包围了。
杜聿明
被包围之后，杜聿明召集兵团司令开会，孙元良是坚决主张赶紧突围的，但是邱清泉主张按照统帅部的命令，去救援黄维兵团。打了两天打不动，杜聿明又找兵团司令开会，决定突围。各自回去之后，李弥和邱清泉都发现突围不行，还不如就地坚守待援，所以他们都在电话上和杜聿明商量，放弃突围。
就在这时候，孙元良又关掉了电台，下令两个军以营为单位，分散突围。一开始的命令是跟着邱清泉兵团走，邱清泉兵团在前面打，孙元良兵团跟在后面冲出去就行了，后面发现邱清泉兵团不突围了，就只好自己往外冲，结果整个全都乱了，冲出去的人很少，孙元良一个人逃到商丘，TUO离战场，整个兵团则完全混乱，要么是被解放军俘虏，没有冲出去的就是被邱清泉兵团收容，后来整编为一个师，归七十四军邱维达指挥，参加了剩下的战斗。
